Docteur en médecine de la Faculté de Bordeaux (1959), ancien élève de l'École de service de santé de la Marine et de la France d'outre-mer, Pierre Aubry opte pour le Corps de santé des troupes d'outre-mer (1960).
Il effectue plusieurs séjours en position hors-cadre des armées (1960-1995), à Madagascar, en Polynésie française, au Bénin, en Algérie, au Sénégal, au Burundi. Il retourne comme coopérant civil à Madagascar (1995-1999).
Il passe les concours hospitaliers et d'enseignement du Service de santé des armées avant d'être nommé professeur titulaire de médecine tropicale à l'Institut de médecine tropicale du Pharo à Marseille (1984). Parallèlement, il acquiert, à titre civil, la qualification en médecine interne et en médecine exotique et la spécialité des maladies de l'appareil digestif et de la nutrition.
Professeur émérite de la Faculté de médecine d'Antananarivo, à Madagascar (1999), il occupe actuellement le poste de professeur visiteur de l'Université Victor Segalen Bordeaux 2 et poursuit l'enseignement de la médecine tropicale à l'île de la Réunion.
Il est membre titulaire de la Société de pathologie exotique de Paris et membre associé de l'Académie nationale malgache des arts, des lettres et des sciences.
Ses travaux concernent la médecine tropicale et l'hépato-gastro-entérologie africaine. Il s'intéresse à l'histoire de la médecine outre-mer et publie sur l'histoire des médecins de Marine en poste à La Réunion depuis la colonisation de l'île.
Il ouvre un site de médecine tropicale qu'il tient régulièrement à jour (dès 2002), et préside deux fois par an le Comité local de la Société de pathologie exotique créé à La Réunion ( 2003).
Pierre Aubry est élu membre correspondant de la 4e section de l'Académie des sciences d'outre-mer le 06/11/2009.
Ouvrages :
Médecins, chirurgiens, apothicaires français de la marine et des colonies : XVIe-XIXe siècle. Paris : l'Harmattan, décembre 2022 (co-auteur)
La France et ses médecins en Extrême-Orient du XVIe au milieu du XXe siècle. Paris : l'Harmattan, 2022 (co-auteur)
La France et ses médecins aux Amériques du XVIe au XIXe siècle. Paris : l'Harmattan, 2021 (co-auteur)
Médecins et expéditions coloniales françaises au XIXe siècle : Afrique Noire et Madagascar. Paris : l'Harmattan, 2020
Jean et Charles-Guillaume Viguerie : la chirurgie toulousaine aux XVIIIe et XIXe siècles. Paris : l’Harmattan, 2018
Médecin conchyliologue et océan Indo-Pacifique. Paris : l’Harmattan, 2018 (co-auteur)
Histoire de la médecine à l'île Bourbon-La Réunion. Paris : l'Harmattan, 2017 (co-auteur)
Passeport santé pour l'Afrique. Saarbrücken : Éditions universitaires européennes, 2015
Histoire des eaux thermales à La Réunion : Cilaos, Hell-Bourg, Mafate, Bras Cabot. Sainte-Marie : Azalées, 2012
Splendeurs et dangers de la faune marine : envenimations, intoxications, blessures, traitements. Montrouge : X. Montauban, 2010
Articles et chapitres d'ouvrages :
La fièvre de Lassa : plus que jamais d'actualité en 2018. In Journal International de Médecine, 27/02/2018
Mycobacterium leprae. in Précis de Bactériologie clinique, 3e édition. Ouvrage collectif sous la direction de Jean Freney et Philippe Riegel. Editions ESKA, 2018, N° 55, 853-861.
HTLV-1 infection in Reunion. In Médecine et maladies infectieuses, 2017
Une énigme non résolue : la « gale chinoise » il y a 150 ans. In Médecine et santé tropicales, 2017, 27, pp. 126-130
Rickettsiales (Rickettsia, Orienta, Anaplasma, Ehrichia. In EMC-Biologie médicale, 2017, 12(1), pp. 1-11 [Article 90-05-0251-A]
Le paludisme dans l’Archipel des Comores : état des lieux en 2015 après 15 années de lutte. In Bulletin de la Société de pathologie exotique, 2016, 109, pp. 107-113 (co-auteurs M. Toyb, A. Ouledi, B.-A. Gaüzère)
Histoire de la santé dans l’océan Indien : solins, prévention, enseignement et recherche du XVIIe siècle au milieu du XXe siècle. In Médecine et santé tropicales, 2016, 26, pp. 122-129 (co-auteur B.-A. Gaüzère)
La pandémie de grippe espagnole de 1918-1919 à la Réunion. In Médecine et santé tropicales, 2015, 25, pp. 13-20 (co-auteur B.-A. Gaüzère)
Les maladies non transmisssibles dans les îles du sud-ouest de l’océan Indien. In Bulletin de la Société de pathologie exotique, 2015, 108, pp. 153-154 (co-auteurs P. Bovet, B.-A. Gaüzère)
Mycobacterium leprae. In Actualités permanentes en microbiologie clinique, 2015, Tome II, Section VI, Chapitre 5, Actinomycetes et mycobactéries, pp. 1/11
Nécrologie de Jacques Voelckel. In Mondes et Cultures, tome LXXIII-2013, 1, pp. 268-269
La maladie appelée « Le Barbiers » au XIXe siècle. In Médecine et santé tropicales, 2014, 24, pp. 241-246 (co-auteur B.-A. Gaüzère)
Cryptococcose. In Mycologie médicale, 2013, pp. 261-279 ; Chromomycose. In Mycologie médicale, 2013, pp. 339-359 ; Histoplasmoses. In Mycologie médicale, 2013, pp. 455-479
Actinomycétome du genou à Nocardia otitidiscaviarum aux Comores. In Annales de dermatologie et de vénéréologie, 2013, 140, pp. 287-290
Situation et enjeux sanitaires aux Seychelles en 2012. In Médecine et santé tropicales, 2013, 3, pp. 256-266 (co-auteurs P. Bovet, J. Gédéon, M. Louange)
Histoire de la lèpre à La Réunion du début du XVIIIe siècle à nos jours. In Médecine et santé tropicales, 2013, 23, pp. 281-286 (co-auteur B.-A. Gaüzère)
HTLV-1 infection in the South West Indian Ocean Islands, particulary in La Réunion and the Seychelles. In Bulletin de la Société de pathologie exotique, 2013, 106, pp. 248-523 (co-auteurs P. Bovet, D. Vitrac, F. Schooneman)
Histoire des épidémies et de endémoépidémies humaines dans le sud-ouest de l'océan Indien. In Médecine et santé tropicales, 2013, 23, pp. 145-157 (co-auteur B.-A. Gaüzère)
Les médecins, chirurgiens et pharmaciens de Marine et les eaux thermales de La Réunion. In Médecine et santé tropicales, 2013, 23, pp. 379-383 (co-auteur B.-A. Gaüzère)
L'infection à virus Chikungunya dans l'océan Indien : leçons et perspectives. In Médecine tropicale, 2012, n° 72/Spécial Chikungunya, p. 6 (co-auteurs B.-A. Gaüzère, P. Gérardin, D. Vandroux)
Les épidémies de choléra à La Réunion au XIXe siècle. In Médecine et santé tropicales, 2012, n° 22, pp. 131-136 (co-auteur B.-A. Gaüzère)
Alexandre Reydellet, chirurgien de la marine (1793-1859) : une vie consacrée à la lutte contre la variole à La Réunion. In Médecine et santé tropicales, 2012, n° 22, pp. 266-269 (co-auteur B.-A. Gaüzère)
Histoire sanitaire et enjeux sanitaires de l'Union des Comores en 2012. In Médecine et santé tropicales, 2012, n° 22, pp. 346-355 (co-auteurs A. Ouledi, M. Toyb, B.-A. Gaüzère)
A sporadic case of genotype 3f acute hepatite E in Mayotte. In Médecine et maladies infectieuses, 2011, 41, pp. 392-394
Le service de santé et la colonne expéditionnaire au Dahomey en 1892. In Bulletin de l'Association amicale santé navale et outre-mer, 2011, n° 121/ 91, p. 55
Le Père Clément Raimbault, médecin des lépreux à l'île de La Réunion. In Bulletin de l'Association des léprologues de langue française, 2011, n° 26, p. 38 (co-auteur B-A. Gaüzère)
Jules Michel Emily, médecin à la Mission Marchand : de Loango à Djibouti par Facoda (1896-1899). In Bulletin de l'Association amicale santé navale et outre-mer, 2010, n° 120/90, p.19